次氯酸钠发生器工作原理按一定比例配制的食盐水，放入电解槽中，在插入电极和通入一定直流电源的作用下，食盐溶液由于电离子的移动和电极反应，发生导电作用，氯根、氢氧根等负离子，向阳极移动，而钠离子和氢离子则向阴极移动。由于这种的电离的作用过程，为此便产生了次氯酸钠。
电解过程可用下列方程式表示：NaClNa++ClH2OH++OH阳极的电解作用是：2Cl--2eCl2阴极的电解作用是：2H++2eH2电解液在专用隔膜的电解装置中，电解过程中的氢气从溶液里向外逸出，它还能对溶液起到一定的搅拌作用，使电极间的电解生成物发生一系列化学反应，并加速进展。这个过程中的反应原理还可用如下方程式表示：2NaCl+2H2O=2NaOH+H2+O22NaOH+Cl2=NaClO+NaCl+H2O在有隔膜的电解装置中，溶液反应时的总方程式即为上述二式之和，即表示为：NaCl+H2O+2F=NaClO+H2式中：F为法拉第电解常数电解食盐水生成次氯酸钠的基本原理，所示。
操作程序首先将固体食盐加入定量容器之中，加水到一定位置，然后用机械充分搅拌均匀，待食盐全部溶解后，大约10分钟的时间即可打开阀门，进入储液箱备用。用流量计控制，将食盐溶液流入电解槽，打开电源开始工作。然后将直流电源打开，调节至规定的电流值，并调节好冷却水，将循环电解槽的末槽的电解液温度控制在2035之间即可。
技术指标控制次氯酸钠用于循环水杀菌灭藻，水中的浓度必须控制在2g/m35g/m3之间；次氯酸钠发生器的出力控制在300g/m3；循环水总量达4000m3；一次性加药2767h（加药可间断进行，每次2030min并清洁一次电极与管道）；加药的次数根据季节的变化而适当调整（夏季需要1520天一次；冬季要20天一次。
藻类增加严重时，可再适当增加加药的次数）。
杀菌机理当次氯酸钠投入循环水池中以后，它可穿透细菌的细胞壁，从而杀死细菌及藻类。杀灭的藻类死亡后从波型板及池壁脱落，形成淤泥并沉入池底，从而改善了现有冷却塔的热交换效果。在加药的间断期间，水中的残留次氯酸钠对细菌及藻类生成还有一定的抑制作用，从而还能减缓藻类的再次形成速度。
注意事项食盐溶液的配比应调节适当，一般以13%为宜，*高不能超过35%.食盐溶液必须经过沉淀后才能使用，否则会因大量结污而堵塞管道和电极，导致设备不能正常工作。在电解食盐水期间，必须保持各处的通电导线接头接触良好，以免在大电流工作的情况――下接――头发热而损坏电解设施。导线及其配套附属设施，都应配备适当合理，并保持完好的工作状态。
注重电极的极性，不得接反，否则会损坏电极。经常观察食盐溶液和冷却水的流通情况，防止结垢堵塞管道。运行时常观察电解电源的电压、电流值是否符合规定值要求。
在运设备每2030小时，利用自动停机间隔，将盐水关阀闭，排空电解槽中余氯，打开冲洗阀进行反冲洗一次，防止电解循环槽中污垢大量的沉积，以免影响电解效果。冲洗好后，关闭冲洗阀及排空阀，打开盐水阀，恢复自动运行状态。电解工作中，有效氯的含量应控制在1%以内，若含量太高，可适当降低电解液浓度或加大氯排放量，否则就会对电极的使用寿命有影响。
结论冷却循环水投加次氯酸钠消毒，的确可以有效地杀死滋生的细菌与藻类，对提高冷却塔的换热效果起到很大的作用。在用水量相对比较大而又集中，且水资源比较短缺的地点，使用次氯酸钠作为杀菌消毒还是比较经济的，具有广泛推广应用的前景。
