（1）反映不出建设先后顺序、主从关系和资金使用的时间、空间的秩序，只是单纯从会计的角度规定我国工程造价的构成，体现不出工程造价管理的清晰思路，实施起来容易混淆。
（2）不能体现出建筑产品优质优价的原则。业主总是希望工程质量好价格低，然而建造高质量的工程比建造普通合理的工程投入要大。虽然政府最近做了调整，允许双方在自愿的原则下收取优良工程补偿费，但是如果一方不同意，所投入的费用就不能收回。因此，这种方法操作起来不好掌握，容易造成工程质量不优业主不满意，创优质工程施工企业投入必须加大，两者之间的矛盾显而易见。
（3）不利于招标工作的展开。现行的工程造价计算复杂，耗时费工，不但要套用”定额直接费”，还要计算材料价差及套用定额收取管理费等。同时从理论上讲，一样的图纸套用一样的定额，按一样的信息价计算，所得的结果应该是一样的。但是由于操作人员理解不同，水平有差异，往往得出的结果有很大差异，使得招标工作考察的并不是企业的综合能力，而是考核预算员的理解能力和运气，谁做的工程预算跟标底”碰”上了，谁中标的可能性就大，明显的不公平、不合理。
